据肠道相关方面研究报告指出，即使同一个人，只要季节变换或所吃的食物不同，肠道菌的组成也会呈现多元的变化。因此，我们要特别注意饮食的内容。
肠道菌每天都会因摄取的食物而发生变化。哪怕只有四天，其饮食内容也会影响肠道菌的组成。尤其是在四天之内，如果摄取的食物是以动物性蛋白质和脂质为主，缺乏膳食纤维的食物，就会让肠道菌无法生成短链脂肪酸(丁酸、乙酸、丙酸)，其变化是相当明显的。其中，丁酸具有抑制肠道黏膜发炎的效果，是维持人体正常免疫功能的重要物质。
以动物性蛋白质为主的低纤维食物会造成丁酸低下，使能产生丁酸的细菌的数量下降。一旦饮食恢复正常后，四天所造成的肠道菌变化，只要两天的时间就能回到原来的状态。
肠道菌的基本构成其实相当稳固，就算饮食稍微不正常，还是可以恢复原状的。可是如果不正常的饮食持续一个月、甚至长达一年，那么已经混乱的肠道菌，就有可能被当做常态而固定下来。坏的肠道菌组成，在短时间之内就不会轻易变化，因此想要恢复原状，就得花较多的时间才能改善。
肠道的起点是口腔
大家已经知道，肠内环境以及肠道菌的组成和免疫力之间的关系了。但你们晓得肠道的位置在哪里吗？一般人听到「肠道」这个名词时，脑海中浮现的画面通常是「在肚子里面」、「胃下面的器官」。然而，肠道的起点其实是「口腔」。肠子是消化器官，其范围从嘴巴直到肛门。因此提到肠内环境时，也不能忘记「口腔环境」。
口腔内约有七百多种细菌，口腔里存在许多不同的细菌。荷兰人安东尼．范．列文虎克( AntonievanLeeuwenhoek) 在1674 年时，观察自己的齿垢后发现「里头有小型生物活跃地活动」。口腔内细菌仅次于大肠，是人体第二大的微生物集团。口腔内的平均温度为37度，唾液PH值在6.5至7之间，呈弱碱性，这对细菌来说是一个安定的繁殖环境。
到目前为止，人类已经发现口腔中的常见细菌约有700多种，而且其数量在一毫升的唾液中为一亿至一百亿个，1克的齿垢里就存在和粪便中数量相当的细菌。除此之外，口腔中还有原生动物、真菌、病毒等不同型态的微生物共存。因此每天当我们吞咽唾液或吃饭的同时，就会有约1兆个以上大量的微生物被我们吞进肚子里。
这些进到我们体内的细菌，大部分都会被胃酸处理掉。然而，胃酸的分泌能力会随着年龄增长而逐渐低下。因此，年纪越大，就有越多的细菌会直接通过胃部。如此一来，只要口腔环境不佳的话，自然不难想像其后的肠内环境也会受到波及。
口腔内细菌和人类实为一种共生的关系。口腔中黏膜和牙齿表面因为都附着口腔内细菌，所以才能维持一个让其他病原菌无法附着的环境。然而，不良的饮食习惯、抽烟和饮酒，则会破坏这种共生生物的生存环境。另外最容易破坏口腔环境的就是砂糖。口腔内细菌会使砂糖发酵，创造出乳酸等酸性物质造成牙齿腐蚀。当口腔内的环境酸性偏高，细菌的组成会发生变化，使得坏菌增加，进而引发牙周病。
想要改善肠内环境，就从口腔开始！
改善口腔环境的方法是：
- 减少吸烟和饮酒
- 定期到牙医洗牙以及预防牙周病
- 每天可进行一次舌头清洁（刮舌苔）